Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms