Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX8Q6ZV50 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX8Q6ZV50 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms