Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
LRRC9Q6ZRR7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
LRRC9Q6ZRR7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
LRRC9Q6ZRR7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms