Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Topbp1Q6ZQF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Topbp1Q6ZQF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Topbp1Q6ZQF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms