Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot1Q6ZQ08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot1Q6ZQ08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms