Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC141Q6ZP82 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC141Q6ZP82 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
CCDC141Q6ZP82 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms