Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL4Q6XD76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.8 ms