Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcl3Q6W5C0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl3Q6W5C0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms