Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCBE1Q6UXH8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms