Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300ld3Q6SJQ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms