Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CRIP3Q6Q6R5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms