Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc57Q6PHN1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc57Q6PHN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms