Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc82Q6PG04 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc82Q6PG04 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc82Q6PG04 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms