Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrt3Q6PE13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrt3Q6PE13 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt3Q6PE13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms