Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd4Q6PDQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd4Q6PDQ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd4Q6PDQ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd4Q6PDQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms