Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MylkQ6PDN3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MylkQ6PDN3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MylkQ6PDN3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms