Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbtb40Q6PCS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Zbtb40Q6PCS8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbtb40Q6PCS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zbtb40Q6PCS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
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