Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhb9Q6PB60 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1348.7 ms