Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AtminQ6P9S1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtminQ6P9S1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms