Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NesQ6P5H2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NesQ6P5H2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NesQ6P5H2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms