Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg2aQ6P4T0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms