Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac4Q6NZM9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms