Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krba1Q6NXZ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krba1Q6NXZ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms