Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpbp1Q6NXH3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1Q6NXH3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms