Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3bQ6NWW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3bQ6NWW9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fndc3bQ6NWW9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc3bQ6NWW9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms