Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SWSAP1Q6NVH7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms