Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Colgalt2Q6NVG7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colgalt2Q6NVG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms