Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bfsp2Q6NVD9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bfsp2Q6NVD9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bfsp2Q6NVD9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bfsp2Q6NVD9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms