Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SphkapQ6NSW3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SphkapQ6NSW3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
SphkapQ6NSW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SphkapQ6NSW3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SphkapQ6NSW3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms