Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retreg2Q6NS82 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retreg2Q6NS82 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms