Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pdcd11Q6NS46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pdcd11Q6NS46 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pdcd11Q6NS46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms