Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med13lQ6JPI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med13lQ6JPI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med13lQ6JPI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med13lQ6JPI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med13lQ6JPI3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med13lQ6JPI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med13lQ6JPI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med13lQ6JPI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med13lQ6JPI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms