Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep78Q6IRU7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep78Q6IRU7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms