Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYW3Q6IPR3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYW3Q6IPR3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms