Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nop58Q6DFW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nop58Q6DFW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nop58Q6DFW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms