Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rftn1Q6A0D4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn1Q6A0D4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms