Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Swap70Q6A028 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swap70Q6A028 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Swap70Q6A028 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms