Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Sh3rf1Q69ZI1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Sh3rf1Q69ZI1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Sh3rf1Q69ZI1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3rf1Q69ZI1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3rf1Q69ZI1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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