Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BegainQ68EF6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms