Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEF1DP3Q658K8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEF1DP3Q658K8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEF1DP3Q658K8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms