Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hist2h2beQ64524 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms