Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Top2bQ64511 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Top2bQ64511 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Top2bQ64511 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Top2bQ64511 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms