Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf1Q64213 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf1Q64213 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf1Q64213 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms