Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddr2Q62371 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr2Q62371 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddr2Q62371 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms