Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsnQ62348 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsnQ62348 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsnQ62348 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsnQ62348 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsnQ62348 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TsnQ62348 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsnQ62348 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TsnQ62348 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsnQ62348 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsnQ62348 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsnQ62348 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TsnQ62348 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TsnQ62348 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsnQ62348 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TsnQ62348 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsnQ62348 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsnQ62348 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsnQ62348 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TsnQ62348 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsnQ62348 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TsnQ62348 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsnQ62348 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TsnQ62348 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TsnQ62348 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TsnQ62348 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TsnQ62348 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TsnQ62348 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TsnQ62348 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TsnQ62348 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms