Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim21Q62191 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim21Q62191 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms