Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rai1Q61818 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Rai1Q61818 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rai1Q61818 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rai1Q61818 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai1Q61818 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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