Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp3Q61810 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ltbp3Q61810 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ltbp3Q61810 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms