Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Itga6Q61739 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itga6Q61739 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Itga6Q61739 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms