Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn2Q61330 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntn2Q61330 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms